Lëndët:

• Leksione ne biologjine qelizore ne degen e Biologji-kimise ne vitin e pare ne Fakultetin e Shkencave te Natyres Shkoder
• Leksione ne biologjine e pergjithshme ne degen e Infermjerise ne vitin e pare ne Fakultetin e Shkencave te Natyres Shkoder.
• Leksione ne biologjine qelizore ne degen e Biologji-kimise partajm ne vitin e pare ne Fakultetin e Shkencave te Natyres Shkoder.
• Leksione ne biologjine e pergjithshme ne degen e Fizioterapise ne vitin e pare ne Fakultetin e Shkencave te Natyres Shkoder.
• Leksione ne biologjine e pergjithshme ne degen Mami ne vitin e pare ne Fakultetin e Shkencave te Natyres Shkoder.
• Leksione ne biologjine qelizore ne degen e Biologji-kimise ne vitin e pare ne Fakultetin e Shkencave te Natyres Shkoder
• Leksione ne biologjine qelizore ne degen e Biologji-kimise partajm ne vitin e pare ne Fakultetin e Shkencave te Natyres Shkoder.
• Titullare e lendes te Biologjise Humane ne degen e Psikologjise ne universitetin e Tiranes
• Leksione dhe seminare: Gjenetika e mutacionevene te induktuara DND te bioteknologjise viti I
• Baza të Shkencës Shtazore bachelor Bioteknologji
• Biologji e përgjithshme dhe Humane BA I (Stomatologji, Infermjeristike, U.Kristal)
• Gjenetika e mutacioneve te induktuara MSH BT I
• Bioteknologjia e ekosistemeve ujore Bioindikatoret MSH BT II
• Vlerësimi Ruajtja Krijimi i bimëve me interes ekonomik MSH BT II
• Bioindikatoret për vlerësimin e gjendjes ne mjedis MP BTM I
• Evolucioni dhe ruajtja e biodiversitetit MP BTM I
• Bioteknologjia e sistemeve ujore-bioindikatoret Shkollën e doktoraturës, në programin: Bioteknologji bimore
• Gjenetika e mutacioneve te induktuara Shkollën e doktoraturës, në programin: Bioteknologji bimore
• Vlerësimi, ruajtja, krijimi i bimëve me interes ekonomik. Shkollën e doktoraturës, në programin: Bioteknologji bimore

Monografi

• F. Babani, E. Kongjika, A. Mullaj, A. Ylli. Trophic state of Albanian water ecosystem based on phytoplakton photo-synthetic pigments Rivers and citizens. Cross-border experiences in environmental protection and sustainable development; Edited by M. Pina, V. Uricchio, M. Aresta, A. Basset Bari 2007; p. 26-35

Artikuj shkencorë:

• Temali, A., Ylli, A., (2017) Variations of photosynthetic pigments of the specie Najas marina related to the water quality in the opposite shore of Skadar Lake" International Educational Scientific Research Journal (IESRJ) Vol.3 Issue.1, January E-ISSN No: 2455-295X Impact Factor Value 4.471: pp 5-11
• Temali, A., Ylli A., (2017) Evaluation of the quality of Skadar Lake waters through the determination of Dissolved Oxygen and Biological Oxygen Demand" International Educational Scientific Research Journal (IESRJ) Vol:3 Issue:3, July E-ISSN No : 2455-295X Impact Factor Value 4.471: pp 120-123
• Temali, A., Ylli, A., (2017) Photosynthetic pigments content of Trapa natans specie in Skadar Lake, International Journal of Environment, Agriculture and Biotechnology (IEJAB) Vol-2, Issue-4, July-August- ISSN: 2456-1878, Impact Factor 3.118, DOI:10.22161/ijeab: pp 1673-1676
• Ylli, A., Koci –Kallfa, A., (2016) The importance of preserving the ekosistem of the Vilun Lagoon, AKTET, Journal of Institute Alb- Shkenca Vol XI/1 ISSN 2070-2244, P 1-5.
• Ferati, F., Kraja–Ylli, A., (2016) “Multivariate Statistical Analysis for the Surface Water Quality of Trepça and Sitnica Rivers, Kosovo“ J. Int. Environmental Application & Science, Vol. 11(1): 92-99
• Ylli, A., Babani, F., Bacu, A., Koci–Kallfa, A., Stamo, I., Lame, S., (2015) Laguna e vilunit dhe rendesia e ruajtjes se ekosistemit. Programet kombetare te kerkimit dhe zhvillimit Vellimi II AKTI, ISBN :978-9928-179-81-4 p. 151-161
• Temali, A., Ylli, A., Raka, M, Stamo, I., (2015) Photosynthetic pigment content in some important associations of the vegetation in Skadar Lake". Aktet Reviste Shkencore e Institutit Alb-Shkenca. Vëll.VIII, Nr.1, /Vol.VIII, Nr.1,: pp 43-46 ISSN: 2073-2244
• Temali, A., Ylli, A., Marash, R., (2016) Lake of Shkodra an ecosystem with considerable potentials to support the development of tourism". Economic Vision Internacional Scienific Journal in Economics, Finance, Business and Tourism Vol.3 Tetova, No.5-6: pp 38-47 ISSN: 1857-9566
• Elezi, F., Ylli, A., Ibraliu, A., (2014) ‘Dinamika e zhvillimit te kultivarëve te grurit ne Shqiperi” AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell.VII, Nr. 2. pp 107 – 110, ISSN 2073-2244
• Temali, A., Kraja, A., Stamo, I., (2014) General state of the ecosystem of shkodra lake and its influence on the movements and demographic distribution of the population around. The 2 nd International Conference on Research and Educatıon– “Challenges Toward the Future” (ICRAE2014), University of Shkodra “Luigj Gurakuqi”, Shkodra, Albania ICRAE2014 Conference Proceedings ISSN: 2308-0825
• Ylli, A., Karcini, M., Dodbiba, A., dhe Klemo, M., (2013) Mutagjeneza e induktuar tek fasulja, AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell.VI, Nr. 1. (10-17) ISSN 2073-2244
• Koci-Kallfa, A., Ylli-Kraja, A., Babani, F., (2013) “Considerations on the preliminary productivity and the trophic state of the Vilun lagoon ( Velipoja regjion Shkodra) AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell.VI, Nr. 1. (43-48) ISSN 2073-2244
• Ferhati, F., Kraja-Ylli, A., Kerolli–Mustafa M., (2013) “ The impact of miting industrial processes of “Trepca” complex in the quality of revers Trepca and Sitnica” J. Int. Application &Science ISSN-1307-0428 Vol. 8 (2) : 187-192
• Koci-Kallfa, A., Ylli-Kraja, A., Babani, F., (2013) “Rehabilitation of the Kune wetland ecosystem” International Journal of Ekosistemand Ekology Sciences (IJEES) Vol. 3 (2); 283-286
• Kallfa, A., Kraja, A., Babani, F., (2013) “Studimi i cilësisë së ujërave të ekosistemit kune-vain dhe ndërveprimi i faktorëve fizikë dhe biologjikë në këtë ekosistem” Buletini i Shkencave Natyrore, Universiteti i Tiranes Nr. 15: http:/buletini.fshn.edu.al/ p.126-132
• Jaupaj, O., Stamo, I., Ylli A., Bardhi, N. (2013) “Ne përpjekje per përshtatjen e bimes se grurit me pritshmëri klimatike duke përdorur teknikat e mutagjenezes eksperimentale” Buletini i Shkencave Natyrore, Universiteti i Tiranes Nr. 16: http:/buletini.fshn.edu.al/ p.122-130
• Jaupaj, O., Stamo, I., Malo, V., Bardhi, N., Ylli A. (2013) Comparative considerations on the response of some wheat varieties on late plantin., AJNTS .
• Ylli-Kraja, A., Babani, F., Koci Kallfa, A. (2013) “Water quality and trophic state of Albanian wetlands of the northern Adriatic coastline during 2010 – 2011” Water resources, forest, marine, and ocean ecosystems Albena, Bulgaria (2013) SGEM (449-454) ISBN 978-619-7105-02-5, ISSN 1314-02704, DOI: 10.5593/ sgem, Impact Factor 3
• Ylli, A., Stamo, I., Babani, F., dhe Mullai, A., (2012) Karakterizimi i livadheve nenujore te lagunes se Vilunit AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell.5, Nr 1 ISSN2073-2244 (54-59)
• Ylli, A., Elezi, F., dhe Permeti, M., (2012) Mutagjeneza kimike e zbatuar ne kultivare te grurit te bute AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell.5, Nr 1 ISSN2073-2244 (76-81)
• Stamo, I., Babani, F., Ylli, A., (2012) The effects of induced mutations on agronomik and physiologic parametersin coton variettes AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell. Vell.5, Nr1 ISSN2073-2244 (33-41)
• Ylli, A., Stamo, I., dhe Karcini, M., (2012) Induktimi i mutacioneve ne bimën zbukuruese te tulipanit ICAFE, Korce
• Ylli A, Stamo I, Babani F, Mullaj A. (2011) “Characterization of water quality of the Skadar lake”. AJNTS
• Ylli A, Stamo I, Babani F, Karcini M. (2011) “Chemical mutagens influence on tulip decorative plant.” AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell. IV, Nr. 1. (111-116)
• Gjylaci, E., Ylli, F., Civici, N., dhe Ylli, A., (2011) “Mossbauer stady of iron compaunds in hyperakumulator plant” AKTET Reviste shkencore e institutit te Alb-Shkences Vell. IV, Nr. 1. (19-23)
• Jaupaj, O., Stamo, I., Malo ,V., Bardhi, N., Ylli A. (2011) “ Comperative Study on the response of wheat varieties against Gamma radiation Grown in to different agricultural plots”. Buletini i Shkencave Natyrore. Akadamia e Shkencave, Universiteti i Tiranes
• Ylli, A., etj (2010) Photosynthetic pigments of Zostera noltii and Ruppia cirrhosa in some Albanian lagoons AIP Journals conference Proceedings- January 21. - volume 1203, pp. 1100-1103
• Babani, F., Ylli, A., Stamo, I., Kongjika, E., Kukali, E., (2009) Characterization of Water Quality of Some Albanian Lakes. In “Lakes and Nutrient Loads”, Pogradec. Botimet e punimeve te konferencës.
• Ylli, A., Babani, F., I. Stamo, Mullaj, A., (2009) Characterization of sea grass photosynthetic pigments in some Albanian lagoons. International Conference on “Lakes and Nutrient Loads”, Pogradec. Botimet e punimeve te konferences.
• Imeri, A., Mullaj, A., Babani, F., Ylli, A. (2008). Evaluation of trophic state in Bishtaraka Lagoon. Balwois, 230, ffp 1104, 1/7-7/7. balwois.com/balwois/administration/all papers 2008 country.php - 977k
• Imeri, A., Mullaj, A., Babani, F., Ylli, A., (2007) Bishtaraka lagoon: Flora, vegetation and Trophic state. i Environmental Features and Sustainable Development of the Albanian and Apulian Wetlands. ATTI, Edizioni dal Sud, Universita Degli Studi Di Bari,. p. 59 – 64
• Babani, F., Kongjika, E., Mullaj, A., Ylli, A. (2007) Trophic state of Albanian water ecosystem based on phytoplakton photo-synthetic pigments Rivers and citizens. Cross-border experiences in environmental protection and sustainable development; Edited by M. Pina, V. Uricchio, M. Aresta, A. Basset Bari; p. 26-35
• Babani, F., Mullaj, A., Civici, N., Kongjika, E., Ylli, A., (April 2007) Evaluation of hyperaccumulator plant species grown in metalliferous sites in Albania AIP Journals, , 899, Editor(s): Serkant Ali Cetin, Iskender Hikmet, Dogus University ISBN: 978-0-7354-0404-5 p. 463-46.
• Ylli (Kraja), A., Stamo, I., Babani, F., Mullaj, A., (2007) Biophysical and biochemical parameters of italian wheat genotypes tested in Albanian condition AIP Journals, April, 899,. Editor(s): Serkant Ali Cetin, Iskender Hikmet, Dogus University ISBN: 978-0-7354-0404-5 p. 830-83
• Stamo, I. Ylli (Kraja), A., Dodbiba, A., (April 2007), Induced mutations for improving production on bread and durum wheat AIP Journals, 899,. Editor(s): Serkant Ali Cetin, Iskender Hikmet, Dogus University ISBN: 978-0-7354-0404-5 p. 1134-35
• Dodbiba, A., Kongjika, E., Stamo, I., Ylli (Kraja), A., (April 2007), Same radiation techniques used in the Gu-3 gamma irradiator AIP Journals, 899,. Editor(s): Serkant Ali Cetin, Iskender Hikmet, Dogus University ISBN: 978-0-7354-0404-5 p. 1127-28
• Salillari, A., Stamo, I., Ylli, A., Rusinovci, I., (2006), etj. Konsiderata mbi metodat konvencionale dhe bioteknologjike te permiresimit dhe bujqesia organike ne zhvillimin e bujqesise. Studime biologjike 11 Tiranë, Nr 11. f. 45 - 60.
• Babani, F., Kongjika, E., Mullaj, A., Ylli Kraja, A., (2006) Characterization of trophic state of some Albanian water ecosystems based on phytoplankton photosynthetic pigments. Balwois in "Water Observation and Information System for Decision Support", 139
• Babani, F., Mullaj, A., Civici, N., Kongjika, E., Ylli, A., (2006) Hyperaccumulator plant species grown in metalliferous sites in Albania, June Sofia, Bulgaria IV Balkan Botanical Congress, Plant ecology-Vegetation and habitat diversity, 12.
• Ylli-Kraja, A., Stamo, I., Babani, F., Mullaj, A. (2006) Photosynthetic pigments of seagrasses in some Adriatic lagoons June Sofia, Bulgaria Plant ecology-Vegetation and habitat diversity,
• Babani, F., Kongjika, E., Mullaj, A., Ylli-Kraja, A., (2006) Phytoplankton photosynthetic pigments of some Albanian water ecosystems June Sofia, Bulgaria
• Kraja, A., Stamo, I., Babani, F., Mullaj, A., (2004), Pigmentet fotosintetitk ne fanerogamet e lagunave. Studime Biologjike Tiranë, Nr.9. fq. 38 – 47
• Mullaj A., Babani F., Kongjika E., Vangjeli J., Kraja A., Stamo I, (2004), “Monitorimi i Pasurive te Ekosistemeve Ligatinore te Velipojes Patok Fushekuqes dhe Butrintit Vleresimi i gjendjes se livadheve nen ujore. Tirane 300 f
• Kongjika, E., Babani, F., Mullaj, A., Ylli, A., Stamo, I., (2004) Gjendja trofike e ujrave te lagunave te Karavastase dhe te Nartes. Dinamika Ambientale Delle Aree Umide Della Fascia Costiera Albanese. Divjaka 22 Ottobre f.89-93
• Mullaj, A., Babani, F., Ylli, A., Kongjika, E., Vangjeli, J., Stamo, I., (2004) Monitorimi i flores te bregdetit Adriatik. Dinamika Ambientale Delle Aree Umide Della Fascia Costiera Albanese. Divjaka 22 Ottobre 2004 p.65-72
• Ylli, A., Stamo, I., Babani, F., (2003) Biodiversity and variations of the photosynthetic in some Italian and Albanian durum wheat genotype Third International Balkan Botanical Congress, Sarajevo, Bosna e Hercegovina p 133
• Babani, F., Ylli, A.,. Lichtenthaler, H. K., Langsdorf, G., Buschmann, C., (2003) Screening differences in growth conditions of trees and crop plants by fluorescence imaging Third International Balkan Botanical Congress, , Sarajevo, Bosna e Hercegovina p208
• Stamo, I., Kraja, A., Dodbiba, A., (2003). Disa ndryshime te fituara nga veprimi me mutagjene ne bimet dekorative te tulipanit Studime Biologjike, Tiranë, Nr.7 f 9-17
• Stamo, I., Kraja, A., Cataneo, M., (2003) In vitro culture of the antheres on different Albanian wheat cultivars and lines ( Triticum Aestivum L) AJNTS Tirane, Nr 13 f. 125-133
• Dodbiba, A., Stamo, I., Kraja, A., (2003) Irradiation of wheat and ornamental plant seeds in the GU-3 gamma irradiator BPU-5 Fifth General Conference of the Balkan Physical Union 2003. Vrnjacka Banja ,Serbia and Montenegro p.1707-1710
• Babani, F., Ylli, A., Lichtenthaler, H. K. (2003) Optical properties of leaves on some wheat genotypes. BPU-5 Fifth General Conference of the Balkan Physical Union. Vrnjacka Banja, Serbia and Montenegro p.1703-1706
• Babani, F., Ylli, A., Lichtenthaler, H. K., Langsdorf, G., Buschmann, C., (2003) Multicolour fluorescence imaging to detect high temperature and high irradince stress in wheat genotypes BPU-5 Fifth General Conference of the Balkan Physical Union 2003. Vrnjacka Banja, Serbia and Montenegro p.1699-1702
• Babani, F., Ylli, A., Langsdorf, G., Buschmann, C. Lichtenthaler, H. K. (2003) Fluorescence imaging as a screening technique of photosynthetic membrane activity 4th European Biophysics Congress, 2003, Alicante, Spain, p.219
• Tartari, T., Permeti, M., Stamo, I., Kraja, A., (2002) Transformimi gjenetik, transgjeneza dhe mutagjeneza ne kulturat bujqesore. Bujqesia dhe shkencat bujqesore, Konferenca bujqesore 2002 f 58-62
• Stamo, I., Kraja, A., Permeti, M., Dodbiba, A., Sulovari, H. (2002). Variacioni gjenetik perms induktimit te mutacioneneve fizike dhe kimike ne kulturen e grurit ne vendin tone. Studime biologjike Nr 5-6. f 58-61.
• Kraja, A., Stamo, I., Babani, F., Elezi, F. (2002). Evidentimi i lidhes nepermjet disa parametrave te fotosintezes dhe prodhimit ne kultivaret e grurit te proves kombetare. Studime biologjike Nr 5-6. f 102-105.
• Babani, F, Ylli, A., Stamo, I,. (2002). Studimi i efektit te disa streseve ambientale ne procesin e fotosintezes me ane te fluereshences. Studime biologjike Nr 5-6. f 151-154.
• Ylli, A., Stamo, I., Babani, F., (2001) Biological diversity of wheat cultivars in Albania. Proceedings of the 3rd Seminar “Italo-Albanian cooperation for the enhancement of plant biodiversity”. Bari CIHEAM, 22-24 March 2001, p 79-83.
• Ylli, A., Stamo, I., Babani, F., Kongjika, E., Ricciardi, L., (2001) Adaptation of some Italian durum wheat genotypes to the Albanian environment. Proceedings of the 4th Seminar “Italo-Albanian cooperation for the enhancement of plant biodiversity” Bari CIHEAM, 22-24 March 2001, p187-196.
• Ylli, A., Babani, F., (2001) Mutagen agent effects on the photosynthetic pigment biosynthesis of bread wheat. Proceedings of the 4th Seminar “Italo-Albanian cooperation for the enhancement of plant biodiversity” Bari CIHEAM, 22-24 March 2001, p197-200.
• Dodbiba, A., Stamo, I., Kraja, A., (2001) Dosimetry and irradiation technique of wheat and ornamental plants seeds AJNTS Tirane, Nr 11 f. 56-64
• Stamo, I., Kraja, A., Sulovari, H., (2000) Studimi i efekteve te mutagjeneve fizike dhe kimike ne breznine e M1 ne kultivare te grurit te bute. Studime Biologjike, Tiranë, Nr.4. f 78-87

Artikuj konference:

• Arjana Ylli, Ani Koci (2016) Ruajtja dhe reabilitimi i ekosistemit ligatinor të Kunes [Conservation and rehabilitation of the Kune wetland ecosystem]: Book of Procidings, Takimi i 11 Vjetor Ndërkombëtar i Institutit Alb-Shkenca Tiranë, 01 - 03 shtator 2016, ISBN 978-9928-110-71-8, faqe 147
• Arjana Ylli, Ilirjana Stamo, Laura Binxhija (2016) Influence of mutagens on decorative plants RAD 2016 Fourth international conference on radiation and applications in various fields of research in Nish Serbia. (May 23 – 27, 2016). Conference Proceedings ISBN: 978-86-6125-160-3, p.357
• Arjana Ylli, Malvina Karcini,Laura Binxhija (2016) Induced mutagenesis applied in bean seeds RAD 2016 Fourth international conference on radiation and applications in various fields of research in Nish Serbia. ( May 23 – 27, 2016 ). Conference Proceedings ISBN: 978-86-6125-160-3, P. 358
• Laura Binxhija-Qeska, Ariana Ylli (2016) Studimi i Juniperus communis L dhe Cupressaceae, Juniperus oxycedrus në zona të ndryshme të Kosovës [The study of Juniperus communis L and Cupressaceous, Juniperus oxycedrus in different regions of Kosovo]:, Book of Procidings, Takimi i 11 Vjetor Ndërkombëtar i Institutit Alb-Shkenca Tiranë, 01 - 03 shtator 2016 ISBN 978-9928-110-71-8, faqe 142
• Malvina Karcini, Ariana Ylli, Sonila Sula (2016) Matja e pigmenteve Klorofiliane te bimët e fasules të trajtuara me mutagjenë [Measurement of Chlorophyll Pigments on Bean plants treated with mutagen]: Book of Procidings, Takimi i 11 Vjetor Ndërkombëtar i Institutit Alb-Shkenca Tiranë, 01 - 03 shtator 2016 ISBN 978-9928-110-71-8, faqe 169
• Laura Binxhija, Arjana Ylli (2016) Medical plants in different soils with heavy metals, RAD 2016 Fourth international conference on radiation and applications in various fields of research in Nish Serbia. ( May 23 – 27, 2016 ). Conference Proceedings ISBN: 978-86-6125-160-3, faqe 92
• Binxhia Laura., Ylli Arjana (2016) Juniperus Communis L. and Juniperus oxicedrus L. as a significant Medical Plants. Konference on medicinal and aromatic plants of southeast european countries in Plovdiv Bulgaria (May 26-29, 2016).
• Albana Temali, Arjana Kraja, Ilirjana Stamo, (2014) General state of the ecosystem of shkodra lake and its influence on the movements and demographic distribution of the population around. The 2 nd International Conference on Research and Educatıon– “Challenges Toward the Future” (ICRAE2014), 30-31 May 2014, University of Shkodra “Luigj Gurakuqi”, Shkodra, Albania Abstract ICRAE2014 Conference Proceedings ISSN: 2308-0825
• Flora Zabergja-Ferati, Arjana Kraja–Ylli (2014). Assessment of the ecological status in the area of sitnica and trepça rivers 2nd International Conference on Applied Biotechnology Tirana, Albania, September 22, 2014 Abstracts bosk ISBN: 978-99943-0-367-0 Offered by Shtepia Botuese “DUDAJ”, 2014 faqe (19-20)
• Albana Temali, Arjana Kraja, Ilirjana Stamo (2014) Diffusion of some key species of aquatic macrophytes primary components of the plant associations of Shkodra lake 2nd International Conference on Applied Biotechnology Tirana, Albania, September 22, 2014 Abstracts bosk ISBN: 978-99943-0-367-0 Offered by Shtepia Botuese “DUDAJ”, 2014 faqe (13-14)
• Ariana Ylli, Kostandina Liti (2014) mutagens influence on tulip decorative plant. 2nd International Conference on Applied Biotechnology Tirana, Albania, September 22, 2014 Abstracts bosk ISBN: 978-99943-0-367-0 Offered by Shtepia Botuese “DUDAJ”, 2014 Faqe (39-40)
• Malvina Karçini (Kodhelaj), Arjana Ylli (2014) Induced mutagenesis into legumes plants 2nd International Conference on Applied Biotechnology Tirana, Albania, September 22, 2014 Abstracts bosk ISBN: 978-99943-0-367-0 Offered by Shtepia Botuese “DUDAJ”, 2014
• Albana Temali, Arjana Kraja, Marash Rakaj, Ilirjana Stamo, (2014) Përmbajtja e pigmenteve fotosintetike ne disa nga shoqërimet bimore me te rëndësishme te liqenit te Shkodres. Takimi 9 vjetor ndërkombëtar I Institutit ALB - Shkenca Prishtine Gusht 2014 ISBN 978-9951-518-11-6 (337)
• Arjana Kraja, Malvina Karçini (Kodhelaj) (2014) Metodat bashkëkohore te mësim dhënies. Takimi 9 vjetor ndërkombëtar I Institutit ALB - Shkenca Prishtine Gusht 2014 ISBN 978-9951-518-11-6 (520)
• Flora Zabergja-Ferati, Arjana Kraja–Ylli, Mihone Kerolli-Mustafa (2014) Përcaktimi i metaleve te renda ne ujin dhe sedimentin e lumenjve te Sitnices dhe Trepces zona e Mitrovicës. Takimi 9 vjetor ndërkombëtar I Institutit ALB - Shkenca Prishtine Gusht 2014 ISBN 978-9951-518-11-6 (287)
• Arjana Ylli, Alfred Mullaj, Albana Temali (2014) Gjendja ne ekosistemit ne parkun e Tiranes Takimi 9 vjetor ndërkombëtar I Institutit ALB - Shkenca Prishtine Gusht 2014 ISBN 978-9951-518-11-6 (334)
• Arjana Ylli, Fetah Elezi, Ilirjana Stamo (2013) Studimi i influences se mutagjeneve Fizike dhe kimike mbi materiale bimore dhe krijimi i linjave te reja mutante me tipare te permiresuara, Takimi 8 vjetor nderkombetar I Institutit ALB - Shkenca Tirane Gusht 2013 (319)
• Fetah Elezi, Arjana Ylli, Alban Ibraliu dhe Belul Gixhari (2013) “Dinamika e zhvillimit te kultivarëve te grurit ne Shqiperi” Takimi 8 vjetor nderkombetar I Institutit ALB - Shkenca Tirane Gusht 2013 (228)
• Ferhati Flora, Kraja-Ylli Arjana, Kerolli–Mustafa Mihone, (2013) Vleresimi i gjendjes mjedisore ne zonen e Mitrovices – ndotja e tokes me metale te renda Takimi 8 vjetor nderkombetar i Institutit ALB - Shkenca Tirane Gusht 2013 (263)
• Ylli-Kraja, F, Babani, A. K. Kallfa (2013) “Water quality and trophic state of Albanian wetlands of the northern Adriatic costline during 2010 – 2011” Water resources, forest, marine, and ocean ekosistems Albena, Bulgaria 16-22 June 2013
• Albana Temali, Arjana Ylli, Marash Rakaj (2013) Lake of Shkodra an ecosystem with considerable potentials to support the development of tourism. Konference Shkencore Nderkombetare" Bashkepunimi Rajonal Ekonomik në Procesin e Globalizimit", Fakulteti Ekonomik Universiteti i Tetoves 6-7 dhjetor 2013 Libri i abstrakteve ISBN 978-608-217-014-5 pg 131
• Arjana Ylli,Vilma Kamberi, Albana Temali: (2012) Study of environment indicators of Tirana Artificial Lake. International Conference " Towards Future Sustainable Development" 16-17 nëntor 2012 Shkoder. Book of Abstracts ISBN: 978-9928-4135-0-5 pg 59 Proceeding Books ISBN: 978-928-4011-9-9 pp 469-474.
• Jaupaj O., Stamo I., Bardhi N., Ylli A. Laska A., (2012) Wheat: in search of diverse features to successfully cope with a changing world Ne Konferencen Nderkombetare: “ AgriSciMont”, Podgorice, 22-23 Nentor 2012
• Jaupaj O., Stamo I., Ylli A., Bardhi N. (2012) Ne përpjekje per përshtatjen e bimes se grurit me pritshmëri klimatike duke përdorur teknikat e mutagjenezes eksperimentale” Konferenca Kombetare: “fakulteti i Shkencave Natyrore ne 100 vjetorin e pavaresise” Tirane, 22-23 Nentor 2012
• Jaupaj O., Stamo I., Bardhi N., Dodbiba A., Ylli A. (2012) The genetic improvement of wheat kulture while faring the new trends of global changes. Ne Konferencen Nderkombetare: “Balwois 2012”. Ohrid, 28Maj-2 Qershor, 2012
• Jaupaj O., Stamo I., Malo V., Bardhi N., Ylli A. (2011) Studimi ne breznine e pare te efekteve te induktimit mutacionalne kultivare shqiptare te grurit ne dy zona te ndryshme agronomike. Ne konferencen Nderkombetare “IASH, 2011” Prishtine, 1-4 Shtator 2011
• Jaupaj O., Stamo I., Malo V., Bardhi N., Ylli A. (2011) Comperative Study on the response of wheat varieties against Gamma radiation Grown in to different agricultural plots”. Ne Konferencen Nderkombetare “Bioteknological Divelopments”, Tirane me 20-21 Nentor, 2011
• Ylli, A., Babani, F., I. Stamo, Mullaj, A., (2009). Characterization of sea grass photosynthetic pigments in some Albanian lagoons. International Conference on “Lakes and Nutrient Loads”, Pogradec. Botimet e punimeve te konferences.

Raporte Teknike:

• Ylli A. Etj 2015 Vlerёsimi i eutrofikimit tё ujrave dhe i ujëkëmbimit hidraulik me detin nё sistemin lagunor Vilun – Velipojë me synim përmirësimin e gjëndjes aktuale” (Projektet e AKTIT)
• Ylli A. ( 2011) Evaluation and Utilization of Natural and Mutant Germplasm in Solanaceae Species” Projekt rajonal me ANEA: RER-5-013
• Ylli A. ( 2009) Evaluation on natural and mutant genetic diversity in cereals using nuclear and molecular techniques, Projekt rajonal me ANEA: RER-5-013
• Mullaj A., Babani F., Kongjika E., Vangjeli J., Kraja A., Stamo I, 2007, Monitorimi i flores se vendit dhe lagunave, (Vleresimi i gjendjes trofike te lagunave te bregdetit Adriatik Narte, Velipoje dhe Knalle) 217 faqe.
• Mullaj A., Babani F., Kongjika E., Vangjeli J., Kraja A., Stamo I 2006, Monitorimi i flores se vendit dhe lagunave, (Vleresimi i gjendjes trofike te lagunave te bregdetit Adriatik Patok, Vain dhe Karavasta), 245 faqe
• Mullaj A., Babani F., Kongjika E., Vangjeli J., Kraja A., Stamo I 2005, Monitorimi i flores dhe gjendjes trofike tё ekosistemeve ligatinore tё Velipojёs, Patok – Fushёkuqes dhe parkut kombetar Oher-Prespe) 233 faqe
• Mullaj A., Babani F., Kongjika E., Vangjeli J., Kraja A., Stamo I, (2004) “Monitorimi i Pasurive te Ekosistemeve Ligatinore te Velipojes Patok Fushekuqes dhe Butrintit Vleresimi i gjendjes se livadheve nen ujore. Tirane, 245 faqe
• Mullaj A., Babani F., Kongjika E., Vangjeli J., Kashta L., Kraja A., Stamo I, (2003) “Monitorimi i Flores dhe Gjendjes Trofike te Lagunave te Bregdetit Adriatik”: Vleresimi i pigmenteve fotosntetike te bimeve te lagunave te bregdetit Adriatik. Tirane, 300 f.
• Mullaj A., Babani F., Kongjika E., Ruci B., Vangjeli J., Ibraliu A., Kraja A., Stamo I, (2002) “Monitorimi i Flores te Bregdetit Adriatik. Tirane,

Fushat e interesit:

• Fushat e kërkimit ne të cilat punon janë: Gjenetika e mutacioneve te induktuara,Vlerësimi i biodiversitetit nё sistemet ujorë nëpërmjet indikatorëve mjedisore,, Vlerësimi i cilësisë se ujërave dhe tabanëve nënujore, Efekti i streseve ekstremale ambientale dhe bimët indikatore.

Projekte:

• Projekti: Monitoring of the Flora and Vegetation of Protected Areas of Albania, / Pozicioni: Kerkues Financuesi: (Ministry of Environment) Periudha: 2002 – 2012 every year Rezultati (botime, konferenca): Botimi i studimit: Raport me te dhëna te përpunuara për punën e bere dhe konkluzionet e arritura.(shtate botime te depozituare e Ministrinë e Mjedisit dhe ne Bibliotekën e Akademisë se Shkencave te Shqipërisë )
• Projekti: Assessment of the variability of the eutrophication of waters and biodiversity in Kune-Vain wetland system (Lezha), NPRD "Biodiversity and Environment, Pozicioni: Kerkues Financuesi: Ministria e Arsimit dhe Kultures (Projektet e AKTIT) Periudha: (2007 - 2009)
• Projekti: “Vlerёsimi i eutrofikimit tё ujrave dhe i ujëkëmbimit hidraulik me detin nё sistemin lagunor Vilun – Velipojë me synim përmirësimin e gjëndjes aktuale” Pozicioni: Drejtues i grupit kerkimor Financuesi: (Projektet e AKTIT) Periudha: (2010 - 2014)
• Project: Evaluation on natural and mutant Genetic diversity in cereals using Nuclear and Molecular Techniques, IAEA, Vienna, RER-5-013, Project Leader Periudha : (2007 – 2009)
• Project: Evaluation of Natural and Mutant Resources for increased phytonutrient Levels in Vegetable crops and Potatoes, IAEA, Vienna, RER-5-013, Project Leader Periudha : (2009 – 2011)
• Projektit kombëtar të bashkëpunimit teknik “Support for the improvement of plant productivity and food safety by using radiation and nuclear techniques” Pozicioni: Kerkues Financuesi: Agjencia Ndërkombëtare e Energjisë Atomike Periudha: (2014-2015)
• “Vlerësimi i cilësisë së ujërave dhe ajrit nëpërmjet treguesve fiziko-kimikë dhe biologjikë ne zonën e Liqenit te Pogradecit”. Pozicioni: Kerkues Financuesi: FSHN U.T Periudha: 2016

• Takime koordinatore te ndërsjella per projektet rajonale dhe raportim per punen e bere. “Evaluation on natural and mutant Genetic diversity in cereals using Nuclear and Molecular Techniques”, IAEA, Vienna, RER-5-013, Periudha: (2007 – 2009) me takime te herëpashershme (Vjene, Oher, Plovdiv).
• Takime koordinatore te ndërsjella për projektet rajonale dhe raportim për punën eksperimentale,” Evaluation of Natural and Mutant Resources for increased phytonutrient Levels in Vegetable crops and Potatoes, IAEA, Vienna, RER-5-013, Periudha (2009 – 2011) me takime te herë pashershme, periodike.
• Regional Training Course on PCR Based Molecular Marker Systems Periudha: 30 June - 11 July 2008 Katowice, Poland, Projekti rajonal i bashkëpunimit me ANEA, RER-5-013
• Regional Training Course “Standardisation of Techniques for Quality Evaluation of Solanaceous Food Crops” Periudha: 5-16 September 2011 Budapest, Hungary, Projekti rajonal i bashkëpunimit me ANEA, RER-5-013
• Vizite Shkencore: “Support for the improvement of plant productivity and food safety by using radiation and nuclear techniques” të financuar nga Agjencia Ndërkombëtare e Energjisë Atomike Periudha: 7 - 18 Dhjetor 2015 Në qendrën kërkimore TAEK, Saraykoy Nuclear Research and Training Center në Ankara, Turqi.
• Bashkëkrijuese e një kultivari te ri të grurit Ni_792 nga metagjeneza kimike, i regjistruar në Katalogun Kombëtar te Varieteteve te rinj (me autore krijues Mentor Përmeti dhe Arjana Kraja, Instituti i Kërkimeve Biologjike, Akademia e Shkencave) në bazë të Vendimit te Komisionit Shtetëror për certifikimin e varieteteve: No.3 date 30.11.1996, dhe aprovimin nga Ministria e Bujqësisë dhe Ushqimit me urdhër No.28 date 13.07.2000. Në Dhjetor 2011 u raportua regjistrimi i kultivarit te ri në katalogun ndërkombëtar të kultivarëve të rinj të trajtuar me metagjeneze të Agjencisë Ndërkombëtare te Energjisë Atomike, Vienë, Austri